Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFF3Q07654 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms