Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPAQ06546 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms