Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A2Q05940 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A2Q05940 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms