Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CD164Q04900 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CD164Q04900 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms