Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms