Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF8Q02556 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms