Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 808.4 ms