Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK16Q00536 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms