Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms