Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKOR1P84550 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms