Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms