Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP5P82980 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP5P82980 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP5P82980 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP5P82980 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP5P82980 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP5P82980 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP5P82980 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP5P82980 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP5P82980 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP5P82980 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP5P82980 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms