Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRX1P78414 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRX1P78414 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRX1P78414 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRX1P78414 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRX1P78414 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRX1P78414 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRX1P78414 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRX1P78414 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRX1P78414 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRX1P78414 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRX1P78414 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRX1P78414 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRX1P78414 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRX1P78414 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRX1P78414 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRX1P78414 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms