Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTAG1AP78358 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTAG1AP78358 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTAG1AP78358 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms