Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITX1P78337 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PITX1P78337 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITX1P78337 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms