Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERVK_113P62684 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERVK_113P62684 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms