Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOAP61586 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOAP61586 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOAP61586 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOAP61586 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOAP61586 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOAP61586 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOAP61586 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOAP61586 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOAP61586 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOAP61586 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOAP61586 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOAP61586 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOAP61586 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOAP61586 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOAP61586 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOAP61586 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOAP61586 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOAP61586 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOAP61586 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOAP61586 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOAP61586 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOAP61586 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOAP61586 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms