Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR1AP61163 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTR1AP61163 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms