Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5BP61020 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5BP61020 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5BP61020 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5BP61020 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5BP61020 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5BP61020 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5BP61020 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5BP61020 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB5BP61020 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms