Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTPNP58546 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTPNP58546 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTPNP58546 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTPNP58546 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTPNP58546 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MTPNP58546 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTPNP58546 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTPNP58546 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms