Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms