Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms