Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIPPLY3P57055 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIPPLY3P57055 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms