Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GFRA1P56159 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms