Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNU13P55769 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNU13P55769 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNU13P55769 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNU13P55769 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNU13P55769 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNU13P55769 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNU13P55769 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNU13P55769 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNU13P55769 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNU13P55769 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms