Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC13P55735 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC13P55735 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC13P55735 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC13P55735 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC13P55735 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC13P55735 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC13P55735 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms