Protein–RNA interactions for Protein: P53259

PCP1, Rhomboid protein 1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PCP1	P53259	ALG8	YOR067C	1734 nt		3.22	□□□□□ -1.89
PCP1	P53259	STD1	YOR047C	1335 nt		3.21	□□□□□ -1.89
PCP1	P53259	EBS1	YDR206W	2655 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	AAD3	YCR107W	1092 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YDR271C	YDR271C	372 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	CGR1	YGL029W	363 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YHR182C-A	YHR182C-A	474 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	CTK2	YJL006C	972 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	GPX1	YKL026C	504 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	COQ9	YLR201C	783 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	BET5	YML077W	480 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	INN1	YNL152W	1230 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RFC5	YBR087W	1065 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RIB5	YBR256C	717 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YBR287W	YBR287W	1284 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RAD1	YPL022W	3303 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RPB2	YOR151C	3675 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	TRS85	YDR108W	2097 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	MCD4	YKL165C	2760 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	APE2	YKL157W	2859 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	EMC1	YCL045C	2283 nt		3.21	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SLM2	YNL047C	1971 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	GPM2	YDL021W	936 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	TGL2	YDR058C	981 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ATC1	YDR184C	885 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	GTR2	YGR163W	1026 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	PBA1	YLR199C	831 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SAS5	YOR213C	747 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RRP36	YOR287C	903 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	FDH1	YOR388C	1131 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	TAF6	YGL112C	1551 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.2	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	THR4	YCR053W	1545 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	GPI13	YLL031C	3054 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ERB1	YMR049C	2424 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YEA4	YEL004W	1029 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SCM4	YGR049W	564 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	CDC8	YJR057W	651 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	NNF1	YJR112W	606 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	BUR2	YLR226W	1188 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	NDL1	YLR254C	570 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RPA43	YOR340C	981 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	NUG1	YER006W	1563 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	CDC14	YFR028C	1656 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ULS1	YOR191W	4860 nt		3.19	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	FRE4	YNR060W	2160 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	VIP1	YLR410W	3441 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	APM3	YBR288C	1452 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	VPS9	YML097C	1356 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RPS14A	YCR031C	414 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	TRX3	YCR083W	384 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	STE2	YFL026W	1296 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	COG7	YGL005C	840 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	EST3	YIL009C-A	546 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YBL055C	YBL055C	1257 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RLP7	YNL002C	969 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	NIS1	YNL078W	1224 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YNL303W	YNL303W	348 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SME1	YOR159C	285 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	VPS38	YLR360W	1320 nt		3.18	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	MRH4	YGL064C	1686 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	VPS53	YJL029C	2469 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SEC6	YIL068C	2418 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	BSC1	YDL037C	987 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ATP5	YDR298C	639 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YJL032W	YJL032W	315 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YJL175W	YJL175W	513 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	IMP1	YMR150C	573 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	RCE1	YMR274C	948 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YOR203W	YOR203W	354 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	POL30	YBR088C	777 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	TDA1	YMR291W	1761 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ECM16	YMR128W	3804 nt		3.17	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SEC53	YFL045C	765 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	PEF1	YGR058W	1008 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	AIM26	YKL037W	357 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	NBP1	YLR457C	960 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SPR2	YOR214C	711 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ARL1	YBR164C	552 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	KAR4	YCL055W	1008 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SPT10	YJL127C	1923 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ESA1	YOR244W	1338 nt		3.16	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ECM22	YLR228C	2445 nt		3.15	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	PIG2	YIL045W	1617 nt		3.15	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	ITT1	YML068W	1395 nt		3.15	□□□□□ -1.9
PCP1	P53259	URK1	YNR012W	1506 nt		3.15	□□□□□ -1.9

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