Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms