Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDST1P52848 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDST1P52848 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDST1P52848 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDST1P52848 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDST1P52848 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDST1P52848 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDST1P52848 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDST1P52848 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDST1P52848 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDST1P52848 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDST1P52848 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms