Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms