Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI2P48788 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms