Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDO2P48775 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDO2P48775 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDO2P48775 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDO2P48775 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDO2P48775 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDO2P48775 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDO2P48775 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDO2P48775 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TDO2P48775 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDO2P48775 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDO2P48775 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDO2P48775 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDO2P48775 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDO2P48775 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms