Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME1P48163 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME1P48163 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME1P48163 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME1P48163 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ME1P48163 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ME1P48163 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ME1P48163 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms