Protein–RNA interactions for Protein: P46990

RPL17B, 60S ribosomal protein L17-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BP46990 YDR467CYDR467C 327 nt7.91□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 YIL012WYIL012W 342 nt7.91□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 MSL1YIR009W 336 nt7.91□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 YAR070CYAR070C 300 nt7.91□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 RAD24YER173W 1980 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 SRP54YPR088C 1626 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 DIE2YGR227W 1578 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 TUF1YOR187W 1314 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 YDL086WYDL086W 822 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 SPC19YDR201W 498 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 YEL067CYEL067C 588 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 YEL075CYEL075C 369 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 YER189WYER189W 369 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 OPI3YJR073C 621 nt7.9□□□□□ -1.14
RPL17BP46990 MKT1YNL085W 2493 nt7.9□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 EMP65YER140W 1671 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 ATG21YPL100W 1491 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 AAD4YDL243C 990 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YDR187CYDR187C 519 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YGL165CYGL165C 579 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YHL018WYHL018W 363 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 TOS6YNL300W 309 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YBR242WYBR242W 717 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 MGS1YNL218W 1764 nt7.89□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 CTF3YLR381W 2202 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 VIK1YPL253C 1944 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 SKN7YHR206W 1869 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 TPO5YKL174C 1857 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 HIS1YER055C 894 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 CYC3YAL039C 810 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 BUD28YLR062C 378 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 RDL2YOR286W 450 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 HXT9YJL219W 1704 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 HXT11YOL156W 1704 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 SHS1YDL225W 1656 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YIL108WYIL108W 2091 nt7.88□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YLR152CYLR152C 1731 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 ENO2YHR174W 1314 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 HED1YDR014W-A 489 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 LPP1YDR503C 825 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YDR544CYDR544C 429 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YOS1YER074W-A 258 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YGL193CYGL193C 312 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 NOP19YGR251W 591 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YLR140WYLR140W 327 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 GDT1YBR187W 843 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 DMA2YNL116W 1569 nt7.87□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 RVB1YDR190C 1392 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 TOS2YGR221C 1869 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 CBR1YIL043C 855 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 TSC3YBR058C-A 243 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 OSW7YFR039C 1533 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YHK8YHR048W 1545 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 AVO1YOL078W 3531 nt7.86□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 PRP28YDR243C 1767 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 AMF1YOR378W 1548 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 THI13YDL244W 1023 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 GPI8YDR331W 1236 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 TIF35YDR429C 825 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 PPM1YDR435C 987 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 PAM18YLR008C 507 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 THI12YNL332W 1023 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YPL229WYPL229W 621 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YPR114WYPR114W 948 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 VAC8YEL013W 1737 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 RIO1YOR119C 1455 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 TNA1YGR260W 1605 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 PUS1YPL212C 1635 nt7.85□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 RPL30YGL030W 318 nt7.84□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YGL052WYGL052W 306 nt7.84□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 YGL088WYGL088W 366 nt7.84□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 TDA8YAL064C-A 381 nt7.84□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 ALG11YNL048W 1647 nt7.84□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 SOG2YOR353C 2376 nt7.84□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 HXT5YHR096C 1779 nt7.84□□□□□ -1.15
RPL17BP46990 UBA2YDR390C 1911 nt7.84□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 HAP3YBL021C 435 nt7.83□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 UBX2YML013W 1755 nt7.83□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 RAD61YDR014W 1944 nt7.83□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 MVP1YMR004W 1536 nt7.83□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 HXT14YNL318C 1623 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 MSB3YNL293W 1902 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 PMT1YDL095W 2454 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 STP1YDR463W 1560 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 YGR190CYGR190C 366 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 INA22YIR024C 651 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 AIM1YAL046C 357 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 UBC11YOR339C 471 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 SHG1YBR258C 429 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 SGF29YCL010C 780 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 SPP382YLR424W 2127 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 LSB6YJL100W 1824 nt7.82□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 CKI1YLR133W 1749 nt7.81□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 SAC7YDR389W 1965 nt7.81□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 SUR2YDR297W 1050 nt7.81□□□□□ -1.16
RPL17BP46990 YGL072CYGL072C 360 nt7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms