Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms