Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMPOP42166 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMPOP42166 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMPOP42166 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMPOP42166 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMPOP42166 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMPOP42166 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMPOP42166 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPOP42166 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPOP42166 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPOP42166 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPOP42166 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPOP42166 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPOP42166 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPOP42166 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPOP42166 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPOP42166 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPOP42166 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPOP42166 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMPOP42166 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPOP42166 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms