Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL4P36578 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL4P36578 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL4P36578 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL4P36578 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL4P36578 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL4P36578 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL4P36578 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL4P36578 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL4P36578 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL4P36578 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms