Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP6V1E1P36543 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATP6V1E1P36543 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms