Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLC1P35663 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms