Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT9P35527 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT9P35527 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KRT9P35527 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
KRT9P35527 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KRT9P35527 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT9P35527 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT9P35527 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT9P35527 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT9P35527 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT9P35527 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT9P35527 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT9P35527 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT9P35527 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT9P35527 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms