Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA3P32297 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms