Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSPOP30536 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms