Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TM4SF1P30408 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF1P30408 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms