Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms