Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO2P25791 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO2P25791 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO2P25791 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO2P25791 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMO2P25791 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMO2P25791 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMO2P25791 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO2P25791 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms