Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBG1P23258 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms