Protein–RNA interactions for Protein: P21964

COMT, Catechol O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTP21964 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTP21964 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTP21964 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTP21964 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTP21964 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTP21964 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTP21964 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMTP21964 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMTP21964 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTP21964 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTP21964 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTP21964 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTP21964 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTP21964 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTP21964 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTP21964 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTP21964 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTP21964 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTP21964 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTP21964 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTP21964 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COMTP21964 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTP21964 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTP21964 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms