Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD247P20963 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD247P20963 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD247P20963 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD247P20963 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD247P20963 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD247P20963 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms