Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A1P20849 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms