Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL3P19876 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms